Übersetzte Auszüge (Google Translate) aus dem Bericht:
C60 fullerene against SARS-CoV-2 coronavirus: an in silico insight | Scientific Reports (nature.com)
Abschluss
Die hier vorgestellten Computersimulationen (Andocken und Molekulardynamik) legen nahe, dass C60-Fulleren in der Lage ist, 3CLpro (Blockierung der katalytischen Dyade) und RdRp (Blockierung von Modell 1 und 2) Proteinziele des SARS-CoV-2-Coronavirus mit unterschiedlichen Mechanismen zu blockieren und seine funktionelle Aktivität zu unterdrücken.
Die Simulationen zeigten, dass in allen untersuchten Komplexen C60-Fulleren die Bindungstasche füllte und dort durch die Stapelung und sterische Wechselwirkungen haftete. Kritisch ist, dass für 3CLpro C60 Fullerene die Integrität der katalytischen Dyade verletzt. Alle anderen Änderungen während der Simulationen dort waren nicht signifikant. Im Fall der RdRp-Taschen 1 und 2 fluktuiert das C60-Fulleren nur innerhalb der Bindungstaschen ohne grundlegende Änderungen der zuvor erhaltenen Komplexe. Das umgekehrte Bild wurde in RdRp-Tasche 3 beobachtet, hier taucht C60-Fulleren in die Bindungstasche ein und bleibt dort stecken. Die MMPBSA-Studie hat gezeigt, dass die G-Bindung bei „C60-Fulleren-3CLpro- oder RdRp-Tasche 3“-Komplexen im Vergleich zu anderen in allen Fällen günstiger ist. Und als Hauptkomponente hat EvdW den größten Beitrag zu allen Komplexen. Darüber hinaus sind die Beiträge von Eelect, Gpolar und Gnonpolar fragwürdig und vor allem wegen der Nähe der Energien zu Null oder in einigen Fällen, dass Energien weit größer als Null sind, ungünstig. Und schließlich wurden basierend auf MMGBSA-Untersuchungen günstige und ungünstige Aminosäuren für die Komplexbildung mit C60-Fullerenen entdeckt. Die Ergebnisse der Studie können Erkenntnisse über die Bindung von 3CLpro und RdRp mit anderen Nanobiomaterialien liefern.
Da darüber hinaus die reinen C60-Fullerene eine hochstabile wässrige kolloidale Lösung bilden können und Anticoronavirus-Aktivität aufweisen, erweitert dies ihre Verwendung für prophylaktische und therapeutische Zwecke, was weitere in vitro- und in vivo-Tests erfordert.